Основные научные направления кафедры: 1. “Оптимизация организации диагностики и лечение хирургических болезней (№ 0007872)” В этом направлении за последние 5 лет опубликованы более 40 научных статьей, 3 монографии и 3 учебно-методические пособия и зашищена одна кандидантская диссертация. В этом направлении профессор кафедры Муратов А.А. в 2009 году защищал свою докторскую диссертацию на тему: “Научные основы индустриализации диагностического процесса, индивидуализации лечебной тактики и социализации хирургической практики”. Под его руководством к.м.н. Абдыкалыков К.О. (главный хирург джалалбадской области) работает над докторской диссертацией на тему: «Стратегия оптимизации организации хирургической помощи больным с повреждениями грудной клетки на уровне районных и областных стационаров Кыргызской Республики», преподаватель кафедры общей хирургии медицинского факультета ОшГУ Мадалиев Т.Т. над кандидатской диссертацией на тему: «Оптимизация организации лечебно-диагностической помощи в экстренной хирургии на догоспитальном этапе». А в сентярбе 2024-года преподаватель кафедры хирургических болезней медицинского факультета ОшГУ, аспирант Муратова А.А. Кутуев Ж.А. успешно защитил кандидатскую диссертацию на тему: «Оптимизация оказания помощи пострадавшим с повреждениями кровеносных сосудов в условиях первичного и вторичного звена здравоохранения Кыргызской Республики» КР УИАнын мүчө-корреспонденти, медицина илимдеринин доктору, философия илимдеринин доктору, профессор И.А.Ашимов жана медицина илимдеринин доктору, профессор А.А.Муратов “Медицина философиясы” багытында илимий изилдөөлөрдү жүргүзүшүүдө. 2. . Оптимизация диагностики и хирургического лечения сочетанных заболеваний аноректальной области В этом направлении ведет работу старший преподаватель кафедры общей хирургии медицинского факультета ОшГУ Камчиев К.А. на тему: “Радикальное лечение острого парапроктита в сочетании хроническим геморроем III- IV степени” 3. Релапаротомиядагы хирургиялык ыкмаларды оптималдаштыруу жана алардын алгоритмин, кайрадан жасалган операцияларды компентентик көз карашта обьективдештирүү чараларын иштеп чыгуу. 4. Оптимизация и алгоритм хирургических методов при релапаротомии, выработка методов объективизации повторно выполненных операций с точки зрения компетентности В этом направлении под руководством профессора кафедры Туйбаева З.А. ведет работу врач-хирург Ошской городской клинической больницы Невреев А.А.